3月13日，李济深率粤方代表出席国民党3中全会到达上海，蒋介石借口调停湘案，电请李济深北上赴京。李不顾李宗仁等人的劝阻，于3月13日抵达南京，21日即被蒋介石囚于京郊汤山。至此，蒋介石消除了粤桂联合的顾虑，决定出兵讨伐桂系。
3月20日，廖磊的五十三师出现不稳迹象，当夜，白崇禧化装成廖磊的夫人，在廖磊的帮助下从塘沽登船离开天津。白崇禧听从了宋哲武的劝告，先抵日本，然后经越南返回广西。21日唐生智在天津上岸，蒋介石正式委任唐生智为第五路军总指挥，驻防石家庄。唐生智免去廖磊五十三师师长职务，组建第八军，有李品仙任军长。
3月21日，蒋介石在国民党三中全会上形成决议，永久开除李宗仁、李济深、白崇禧的党籍。3月26日，蒋介石下令讨伐桂系。其以国民政府的名义，在下达的《讨伐令》中称：李宗仁、李济深、白崇禧等“借革命之名义消灭革命”，“实为国民革命之障碍，三民主义之叛徒”，除免去本兼各职，听候查办外，还命令前方各军对桂系所属部队痛加讨伐。
宋哲武在叶长贵走后，找来萧国栋、王叙商量下一步行动计划。宋哲武认为，蒋桂大战一触即发，现在桂系败势已定。南京的蒋介石在讨伐桂系时，为了渲染他的正统地位和中央权威，必然召集个地方实力派共同进剿，讨伐桂系。这正是保安军出兵的好机会，保安军除了第一师打了一场低烈度的战斗，二三两个师还没有经过大战的考验，正好可以把部队拉出去，打上几场大战，锻炼一下队伍，而且还可以引起老蒋的好感。
对于他这个想法，萧国栋、王叙两人都不同意，他们认为涞源必须留下一个师看家。虽然宋哲武一再表示阎锡山这时不敢打涞源的主意，可两人就是不同意。无奈，宋哲武也只好同意。既然决定了出兵，就要先做好安排，按照三人的命令，参谋部立刻行动起来。首先命令二三师做好出兵准备，调魏广惠的骑兵一个旅回涞源，随同辎重旅一同出发，同时各种物资先期向邯郸集结。3月21日，蒋介石在国民党三中全会上形成决议，永久开除李宗仁、李济深、白崇禧的党籍后，立即给林蔚发报，坚决支持蒋委员长讨伐桂系，要求出兵平叛。林蔚很快回电：“闻文戈吾弟支持平乱之意，委员长甚慰。望第积极备战，不日将有命令下达。希吾弟奋勇作战，力建战功！”
3月26日，蒋介石下令讨伐桂系。28日，蒋介石命令朱培德为讨逆军第1路总指挥，率第3、第5军，从九江、南昌西攻武(昌