‘内阁’制如同以前的制度那般，杨侗给了一个方向，交给时代精英们完善。众人不负杨侗所望，只是探讨到半夜，测试版本的‘内阁’就已经横空出世。
内阁设立于乾阳殿东南方、文思殿正南的文成殿，成员七人，授予正四品内阁学士虚职。
根据杨侗的要求，设立一个名叫通政司的下属部门，所有奏疏都先送到通政司，由他们抄录两份，原本送到内阁处理、一份送到皇帝御书房，以供皇帝及时过目，另外一份入库存档。
送到内阁的奏疏，由七名成员议论，给出相应的处理方案，这七人的处理方案根据事情的轻重缓急写在不同颜色的纸张，然后贴在奏疏外，寻常的事务用白纸，接着是绿纸、黄纸，紧急的重大事务则用红纸。
贴好纸条，统一送回政通司，抄录好处理方案，再贴到存档那本归库，七位内阁成员亲笔所写的原本送到御书房。
这时，录事们则要先行浏览分类，如贴上白绿贴纸的奏疏属实，且贴纸上的方案处置得当，便代皇帝批复转回通政司。通政司第一时间分类送到尚书省三仆射之手，让后者给出建议或附议，再转给与内容相应的尚书十部和八寺，对应部寺根据内阁和和仆射指示执行。而贴着黄、红纸的重要奏章才会送到皇帝面前。
录事拟好一个目录，简略注明各道奏疏的内容和内阁的处置，交由皇帝过目。皇帝便可据此筛选一遍，既能做到心中有数，又不会错过重大事务。
对内阁票拟得当的奏疏，皇帝指示录事代为朱批通过。而有疑惑的奏疏，则会亲自观看考究，甚至亲笔指示批复，并由录事代批旨意。若是对内阁票拟结果不满，皇帝也可否定，打回让内阁重拟，或给出自己的处置结果，交由内阁商议。
决议最终形成后，交由中书省拟诏、门下省审核，尚书省执行。录事在这里扮演着皇帝秘书的角色，同时也是智囊顾问。
没有决定权的内阁负责给出处置方案，中书省是决策层，而皇帝是最终决策人，但门下省又有最终的审核权。
如此转了大圈，既保证了皇帝不被百官欺瞒，又让皇帝及时掌握和处置军国政务。皇权和百官相互制约，保证最终的平衡。
虽说杨侗的权威不是百官能够掣肘得了的，但杨侗这么做，是为了保证后代在这框架内不出乱子。既能避免子孙专权乱政，又防止权臣奸相夺权乱国。
但是杨侗也知道这种制度处于草创阶段，肯定还有很多不足之处，最明显的就是会让办事效率变得低下