制度已经阻碍的社会的发展。
比如军户制度，让军户们苦不堪言，纷纷逃亡，躲避兵役，也导致明军的战斗力下降；匠户在官府的作坊做事，也经常遭到官吏的层层盘剥。因此匠户往往用怠工、隐冒、逃亡等手段进行反抗；民户因为要负担最多的赋税、徭役，所以更是苦不堪言。
嘉兴县一个小小的粮长，在收粮的时候，都要额外勒索十八种钱财：定舡钱、包纳运头米钱、临运钱、造册钱、车脚钱、使用钱、络麻钱、铁碳钱、申明旌善亭钱、修理仓廒钱、点舡钱、馆驿房舍钱、供状户口钱、认役钱、黄粮钱、修墩钱、盐票钱、出由子钱。
其他贪官污吏只会更狠。
所以当时就有学者表示，“明之百姓，税加之、兵加之、刑加之、役加之、水旱灾祲加之、官吏之食渔加之、豪强之吞并加之、是百姓一而所以加之者七也。”
也因此大量百姓难以忍受盘剥，而被迫成为流民。剩下的没跑得民众，则担子更重，还要负担那些逃了的人的赋税和徭役，真可以说是惨上加惨。
而那些流民逃亡之后，为了谋求活路，往往为贼为寇，甚至起兵造反，给朝廷造成极大的威胁。