遭到败绩，死伤百余人。最后还目送黄衣贼军浮海而去，毫无办法，活脱脱当年几十万明军“欢送”几千饱掠而回的清军的德行。
面对辽海千里处处烽火的窘境，清军不得不调整作战重心。远在北京的摄政王多尔衮下令，从阿济格与多铎两部清军中各抽调两万人，再辅以新近收编的陕西顺降军、河南明降军三万多人。合兵七万，东调山东、北直隶一线。同时。多尔衮还准备从北京、锦州以及天津驻防满蒙八旗中抽调出数千精锐马队，择一宿将统领南下，统一指挥这总计将近八万名清军，以稳固岌岌可危的北直隶、山东形势，并趁机窥伺江淮一线。
至于辽东，清军则没有好的办法了。年纪十四岁以上、六十岁以下的精壮男子大部分都去了关内或辽西，关外只有一些老幼妇孺，青壮丁口不多，整个辽东加起来也就几千马队、不到一万步卒罢了。这么点兵力要防御这么大的面积，真可谓是力不从心。没办法之下，清廷只能下令沿海的那些实力薄弱的村堡往内陆地区迁移，同时实行“集村并屯”政策，即将这些迁往内陆的村堡居民都集中到一些便于防御的要点内。同时在各要点屯驻机动兵力，一处有事，立刻集结起大股马队前往救援，希望以此能够遏制黄衣贼在沿海地区无休止的骚扰。
清军在调动兵力、调整部署，而东岸人则处在一个难得的休战间歇期内。5月25日，东岸船队尽数集结在利尻岛鸳泊港过冬季地内，计有炮舰2艘、武装运输舰2艘、运输船2艘、蒸汽机帆船6艘（“破浪”号明轮船已调往澳洲）、中型渔船4艘，总吨位超过一万吨，可谓规模庞大。
连续作战一个半月，东岸军队战斗减员不过寥寥八十余人（主要是挺身队和军夫队），非战斗减员也不过才三四十人，却取得了毙伤俘清军一千五百多人的优异战绩。此外，还攻破了关内六州县、辽东金州等四处要地、朝鲜铁山郡等地，缴获粮豆七千多石、牲畜四百余头（只）、战马七十余匹。不光如此，他们在大沽口、皮岛、镇江三地还击沉了清水师五十余艘小船，几乎将其残存的不多水上力量（孔、尚等人已正式转为陆军）全部剿灭。
总得来说，作为烟台会战的一部分，这一个多月的敌后破袭战有力打击了清军的嚣张气焰，极大动摇了其在山东、近畿一带的威信。到了后期，辽东的破袭战更是给了清廷心理上沉重一击。多少年了，这些大后方多少年没被攻打过了？上次被人这么进行大规模敌后破袭怕是要追溯到毛文龙时期了吧？可毛文龙也只有能力攻一些小寨堡，威胁其实有限。但黄